Sledovanie línie SARS-CoV-2 na Slovensku B.1.1.7 Použitie nového, multiplexovaného hodnotenia RT-qPCR

Vedecký zástupca 2021 14. október; 11 (1): 20494. doi: 10,1038 / s41598-021-99661-7.

Zhrnutie

Vznik nového SARS-CoV-2 B.1.1.7 vyvolal globálny poplach v dôsledku zvýšenej prevalencie, neistoty ohľadom úmrtnosti a účinnosti vakcíny, a tým urýchlil úsilie o detekciu a monitorovanie rozptylov. Súčasné prístupy k zisťovaniu B.1.1.7 zahŕňajú nasadenie a testovanie RT-qPCR. Z dôvodu nedostatku programov genetického monitorovania v mnohých krajinách a objavenia nesúvisiacich variantov s mutáciami, ako sú neúspešné odhady P.1.1.7, sme použili rozumné umiestnenie nukleotidov modifikovaných LLA na vytvorenie testu RT-QBCR, ktorý by mohol byť presný a rýchlo diferencované. Z iných typov SARS-CoV-2 B.1.1.7. Test sme testovali na 106 klinických vzorkách s dedičným stavom potvrdeným nasadením a vykonali sme celonárodnú monitorovaciu štúdiu šírenia B.1.1.7 na Slovensku. Náš multiplexovaný test RT-qPCR ukázal 97% klinickú citlivosť a počas troch kampaní uskutočnených do jedného mesiaca sa získalo 6 886 pozitívnych vzoriek SARS-CoV-2, čím sa difúzia B.1.1.7 vystavila v priemere 82%. Laboratóriá B.1.1.7 Tento test je možné ľahko implementovať na rýchle monitorovanie monitorovania a je obzvlášť užitočný v krajinách, kde je odstránený iba 6H69 / ΔV70. .7 Typy.

PMID:34650153 | DOI:10,1038 / s41598-021-99661-7