Subway Swabbers Objavte mikrobový les a tisíce nových druhov

Tímy vedcov a dobrovoľníkov sa rozšírili po systémoch hromadnej dopravy v 60 mestách a od roku 2015 do roku 2017 zhromaždili tisíce vzoriek. Vyrovnali rôzne povrchy vo vnútri tranzitných staníc a automobilov metra, vrátane turniketov, zábradlí, kioskov na lístky a lavičiek. (V niekoľkých mestách, kde neexistoval systém metra, sa tímy zamerali na autobusový alebo vlakový systém.)

Pozornosť často priťahovali expedície vedcov pod zemou. Zvedavosť niektorých cestujúcich sa natoľko zvýšila, že sa pripojili k Dobrovoľníckym výterovým zborom, zatiaľ čo iní trvali na tom, že nechcú presne vedieť, čo sa na stĺpoch metra nachádza. Cestovatelia niekedy zle pochopili, čo vedci robili s ich malými tampónmi. „Muž nám poďakoval za vyčistenie metra,“ povedal doktor Mason.

Vedci tiež zhromaždili vzorky vzduchu pre sprievodný dokument o „vzdušnom mikrobióme“ z tranzitných systémov šiestich miest – New York, Denver, Londýn, Oslo, Štokholm a Hongkong. Publikované v stredu v vestníku Microbiome Journal.

„Je to obrovské,“ uviedla Erica Hartmann, mikrobiologička z Northwestern University, ktorá sa do štúdie nezúčastnila. „Počet vzoriek a geografická rozmanitosť vzoriek – to je bezprecedentné.“

Tím potom extrahoval DNA z každej vzorky a sekvenoval ju, aby identifikoval druhy v nej obsiahnuté. Celkovo medzi všetkými povrchovými vzorkami našli 4 246 známych druhov mikroorganizmov. Dve tretiny z nich boli baktérie, zatiaľ čo zvyšok tvorila zmes húb, vírusov a iných druhov mikróbov.

Ale to bol len začiatok: našli tiež 10 928 vírusov a 748 druhov baktérií, ktoré nikdy neboli zdokumentované. „Mohli sme vidieť, že to boli skutočné – sú to mikroorganizmy – ale nikde v žiadnej databáze sa nenachádzajú,“ Povedala Daniela Bezdan, bývalá výkonná riaditeľka spoločnosti MetaSUB, ktorá je teraz vedeckou spolupracovníčkou vo fakultnej nemocnici Tübingen v Nemecku.

Odborníci tvrdia, že väčšina z týchto organizmov pravdepodobne predstavuje pre ľudí malé riziko. Doktor Danko uviedol, že takmer všetky nové vírusy, ktoré zistil, budú pravdepodobne bakteriofágy alebo vírusy infikujúce baktérie. Ďalej genetické sekvenovanie nedokáže rozlíšiť medzi organizmami, ktoré uhynuli, a tými, ktoré sú živé, a žiadne prostredie nie je sterilné. Naše telo sa v skutočnosti spolieha na bohaté a dynamické spoločenstvo mikróbov, aby správne fungovalo.