Vyšetrovatelia identifikovali na Slovensku široké spektrum typov C ťažkých génov
Niektoré genotypy infekcie Clostridium difficile (CTI) sú bežnejšie pri infekciách získaných z nemocnice ako iné, čo vedie k včasnej detekcii kmeňov hypervírusu.
Tím vedený Elenou Novakovou analyzoval fenotypové a genetické vzorce izolácie C komplexu pacientov s CTI na Jesseniovej lekárskej fakulte v Martine Univerzity Kominiusa v Bratislave.
Problém
Napriek tomu, že ide o najčastejší nozokomiálny patogén a príčinu hnačiek v zdravotníckych zariadeniach súvisiacich s antibiotikami, miera infekcie C. diphtheria sa v posledných rokoch na Slovensku zvýšila.
Štúdia zahŕňala údaje od pacientov s CDI od júla do augusta 2016 z nemocníc v regióne Hornbauze na severnom Slovensku. Vyšetrovatelia tiež identifikovali hypervírusové kmene, ako napríklad RT027 alebo RT176.
„Presná a rýchla diagnostika CDI je zásadná pre optimálnu starostlivosť o pacienta a prevenciu šírenia infekcie,“ napísali autori. „Diagnostické metódy na identifikáciu rôznych cieľov určujú prítomnosť voľných toxínov alebo toxických kmeňov v stolici s hnačkou.“
Zber vzoriek
Tím zhromažďuje biologické vzorky podozrivých na CDI pomocou enzýmu glutamát dehydrogenázy
(GDH), anaeróbna kultúra, toxíny A / B, multiplexná polymerázová reťazová reakcia „v reálnom čase“ (PCR) a reprosystémy elektroforézy na kapilárnej báze PCR a MALDI TOF MS.
Priemerný vek pacienta bol 77 rokov. Vzorky boli odobraté pacientom s vnútorným lekárstvom (n = 29), dlhodobou starostlivosťou (n = 26) a chirurgickým zákrokom (n = 1) a od 4 pacientov, ktorí neboli hospitalizovaní.
Pacienti v štúdii boli hospitalizovaní pre množstvo sprievodných ochorení, vrátane srdcových chorôb (29%), gastrointestinálneho traktu (24%), pľúc (11%), obličiek (5%) a rakoviny (1%). Rovnako ako ostatné chronické choroby.
Súčasné odporúčania na detekciu CDI zahŕňajú viacstupňové diagnostické metódy, ktoré spájajú GTH a Docs EIA s PCR, ktoré sú na túto chorobu vysoko citlivé, ale nerozlišujú medzi symptomatickou CDI a asymptomatickou kolonizáciou.
Celkovo 60 Je ťažké Izoláty zahrnuté v študovaných vzorkách boli testované na prítomnosť toxických génov prostredníctvom multiplexného hodnotenia PCR v reálnom čase.
Hlavné reprodukcie
Celkom 44 izolátov komplexu C bolo identifikovaných pomocou PCR repotypovania, s 5 hlavnými repotypmi – RT001, RT011, RT017, RT081 a RT176.
Prítomnosť superrýchleho RT027 však nebola identifikovaná.
RT001, RT011, RT081 a RT176 sa považovali za citlivé na metronidazol a vankomycín, zatiaľ čo RT017 znižoval citlivosť na vankomycín.
Medzi RT001 a RT176, najrozšírenejšou správou PCR od hospitalizovaných a ambulantných pacientov, neexistuje žiadny štatisticky významný rozdiel, pokiaľ ide o rôzne premenné vrátane albumínu, CRP, kreatínu a dĺžky hospitalizácie (B = 0,175) a glomerulárna filtrácia (B = 0,05).
„Výsledky repotypizácie elektroforézy na kapilárne PCR na študovaných vzorkách ukázali vysokú prevalenciu RT176 a 001,“ napísali autori. Presná a rýchla detekcia CDI je zásadná pre optimálnu starostlivosť o pacienta a prevenciu šírenia infekcie. Laboratórna diagnostika, ktorá zahŕňa vysoko senzitívne skríningové hodnotenie, po ktorom nasleduje hodnotné hodnotenie, je dôležitá pre liečbu a diagnostiku chorôb.
Študuj, „Diagnostika infekcie spôsobenej Clostridioides a Clostridioids hard repotibes v študovanej vzorkePublikované online na Antimikrobiálne látky.