Riziko infekcie BA.5 u jedincov vystavených predchádzajúcim variantom SARS-CoV-2

do redakcie:

V posledných mesiacoch sa Omicron (b.1.1.529) stal dominantnou formou koronavírusu 2 ťažkého akútneho respiračného syndrómu (SARS-CoV-2), ktorý vykazuje určitý stupeň imunitného úniku.¹ Skoré omikrónové podtypy, BA.1 a BA.2, sú v mnohých krajinách postupne vytláčané BA.5, pravdepodobne v dôsledku väčšej prenosnosti a čiastočného úniku imunity vyvolanej BA.1 a BA.2.^2,3 Ochrana poskytovaná BA.1 proti infekcii subvariantom BA.5 je dôležitá, pretože adaptované vakcíny v rámci klinických skúšok sú založené na BA.1.

Portugalsko bolo jednou z prvých krajín postihnutých BA.5 vo veľkej miere. Na výpočet rizika infekcie BA.5 u jedincov s dokumentovanou infekciou predchádzajúcimi variantmi vrátane BA.1 a BA.2 sme použili Národný register chorôb koronavírusu 2019 (Covid-19) (SINAVE). Register zahŕňa všetky prípady hlásené v krajine bez ohľadu na klinický obraz.

Postava 1. Postava 1. Ochranný účinok predchádzajúcej infekcie SARS-CoV-2 na infekciu subvariantom Omicron BA.5.

Ako je znázornené na paneli A, identifikovali sme obdobia (v rôznych farbách), keď bol variant zastúpený vo viac ako 90 % izolátov vo vzorke (údaje z Národného závažného akútneho respiračného syndrómu Coronavirus 2) [SARS-CoV-2] monitorovanie genetickej diverzity⁴) Šedé farby reprezentujú dobu, kedy bol v móde viac ako jeden variant. Vzhľadom na relatívne pomalý prechod medzi dominanciou subvariantu Omicron BA.1 a dominanciou subvariantu Omicron BA.2 sme v analýze spojili BA.1 a BA.2. Nezahrnuli sme nikoho infikovaného v období 90 dní pred dominanciou subvariantu omikrón BA.5. Panel B ukazuje ochrannú účinnosť proti infekcii počas obdobia dominancie BA.5 (od 1. júna 2022) medzi jedincami s jednou infekciou v období dominancie rôznych typov, ako je znázornené na paneli A, bez akýchkoľvek jedincov s nie viac ako dve infekcie pred 1. júnom do 1. júna boli zahrnuté do štúdie v porovnaní s jednotlivcami s dokumentovanými infekciami. Stĺpce predstavujú 95 % interval spoľahlivosti.

Národný genetický dohľad SARS-CoV-2 identifikoval obdobie, keď odroda predstavovala viac ako 90 % izolátov.⁴ Identifikovali sme všetkých jedincov, ktorí mali prvú infekciu v každom type obdobia dominancie, aby sme vypočítali riziko infekcie počas obdobia dominancie BA.5 (Obrázok 1A) z dôvodu pomalého prechodu medzi týmito dvoma podtypmi v populácii sme spojili BA.1 a BA.2. Nakoniec sme vypočítali riziko infekcie BA.5 pre populáciu bez zdokumentovanej infekcie pred dominanciou BA.5 (1. júna 2022).

Zistili sme, že predchádzajúca infekcia SARS-CoV-2 mala ochranný účinok proti infekcii BA.5 (Obrázok 1B a Tabuľka S1 v doplnkovej prílohe, ktorá je k dispozícii s úplným textom tohto dokumentu na NEJM.org) a táto ochrana bola maximálna pri predchádzajúcej infekcii BA.1 alebo BA.2. Tieto údaje by sa mali brať do úvahy v kontexte úspešnej infekcie vo vysoko zaočkovanej populácii, keďže viac ako 98 % skúmanej populácie v Portugalsku dokončilo základnú očkovaciu sériu pred rokom 2022.

Návrh štúdie nemôže eliminovať všetky mätúce faktory (pozri sekciu diskusie v doplnkovej prílohe). Okrem toho je obmedzením potenciačný účinok imunitného riedenia v populáciách s hybridnou imunitou (predchádzajúca infekcia a očkovanie). Zistili sme, že infekcia BA.1 alebo BA.2 u očkovaných jedincov poskytuje väčšiu ochranu proti BA.5 ako infekcia preomikrónovými variantmi, čo je v súlade s nedávnou správou s negatívnym dizajnom testu.⁵ Infekcie BA.1 alebo BA.2 sa však vyskytli bližšie k obdobiu dominancie BA.5 ako infekcie predchádzajúcimi variantmi. Existuje predpoklad, že existuje malá ochrana proti predchádzajúcim infekciám BA.1 alebo BA.2 vzhľadom na vysoký počet infekcií BA.5 u jedincov s predchádzajúcimi infekciami BA.1 alebo BA.2. Naše údaje naznačujú, že táto predstava je pravdepodobne výsledkom väčšieho súboru jedincov s infekciou BA.1 alebo BA.2 ako infekcia inými podtypmi, čo údaje nepodporujú.

Celkovo sme našli úspech so subvariantom BA.5 u jedincov s predchádzajúcou anamnézou infekcie SARS-CoV-2 vo vysoko zaočkovaných populáciách, najmä pri predchádzajúcich infekciách BA.1 alebo BA.2, v porovnaní s neinfikovanými jedincami. Pravdepodobnosť infekcie bola nízka. ,

Joao Malato, MSc
Institut de Medicina Molecular Joo Lobo Antunes, Lisabon, Portugalsko

Ruy M. Ribeiro, D.Phil.
Národné laboratórium Los Alamos, Los Alamos, NM

Pedro P. Leight, MD
Pedro Casaka, MUDr
Eugenia Fernandes, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Lisabon, Portugalsko

Carlos Antunes, Ph.D.
Universidad de Lisboa, Lisabon, Portugalsko

Walter R. Fonseca, MD, Ph.D.
Direção Geral da Saúde, Lisabon, Portugalsko

Manuel C. Gomes, Ph.D.
Universidad de Lisboa, Lisabon, Portugalsko

Luis Graca, MD, D.Phil.
Institut de Medicina Molecular Joo Lobo Antunes, Lisabon, Portugalsko
[email protected]

Tento list bol zverejnený na NEJM.org 31. augusta 2022.