RT176 sa objavuje na Slovensku, čo vedie k prepuknutiu C difficile

Nová analýza nedávneho prepuknutia infekcií Clostridium difficile (CDI) na Slovensku ukazuje prevalenciu určitých ribotypov C. difficile v posledných rokoch.¹

Tím pod vedením Adriany Blankovej z Oddelenia klinickej mikrobiológie Unilabs Inc. identifikoval epidémiu CDI v slovenských nemocniciach po objavení sa ribotypu 176 v roku 2016.

V priebehu rokov sa prevalencia niektorých ribotypov mohla zmeniť.

“Ribotypizácia údajov zo slovenčiny C. Obtiažnosť Izoláty z rokov 2011 až 2013 vykazovali nízku diverzitu ribotypov a jasnú prevahu RT001; C. Obtiažnosť RT176 v tom čase nebola identifikovaná,“ ​​napísali autori. „Neskôr, v roku 2016, došlo v stredisku terciárnej starostlivosti v severnej časti Slovenska k veľkému prepuknutiu 75 prípadov CDI RT176. V tom istom roku sa na celoštátnom sledovaní CDI zúčastnilo 36 nemocníc na Slovensku a predložilo 12 nemocníc. C. Obtiažnosť Izolácia pre charakter.“

V štúdii vyšetrovatelia aplikovali protokol ECDC CDI dohľadu v2.3 na 14 nemocníc v rokoch 2018-2019. Tím zhromaždil ďalšie údaje o nedávnom používaní antimikrobiálnych látok a charakterizácii izolátov C. difficile.

Výsledky ukázali priemerný výskyt CDI na nemocnicu 4,1 prípadov na 10 000 lôžkových dní pacienta s fatálnym výsledkom v nemocnici 27,6 % (n = 105) u 381 pacientov. Antimikrobiálna liečba v predchádzajúcich 4 týždňoch bola zaznamenaná v 90,5 % (n = 333) prípadov.

Ribotyp 176 bol zistený v 50 % prípadov (n = 185; 14 nemocníc), kým RT001 bol zistený v 34,6 % (n = 128; 13 nemocníc) prípadov s údajmi o ribotype. Vyšetrovatelia tiež identifikovali 86 % (n = 318). izoláty Thr82Ile rezistentné na moxifloxacín v Kyra (99,7 %).

Vyšetrovatelia vykonali multilokusovú variabilnú tandemovú opakovanú analýzu a identifikovali klonálne spojenie hlavných RT v rámci a medzi nemocnicami.

Polovica zo 14 nemocníc sekvenovala izoláty RT176, zatiaľ čo 5 z 13 izolátov RT001 vykazovalo 0–3 alelové rozdiely podľa wgMLST.

Väčšina zo sekvenovaných izolátov – 24 z 27 – nesie gén erm(b). Transportovalo sa aj ďalších 16 sekvenovaných izolátov aac(6′)-aph(2′‘) Genóm so súvisiacimi fenotypmi antimikrobiálnej citlivosti.

Bolo tiež 9 kmeňov RT176 cfr(E) Transgénne a nesúce kmeň RT001 cfr(C) Gen. Boli však bez rezistencie na linezolid.

„Novo prevládajúci RT176 a lokálny RT001 riadi epidemiológiu CDI na Slovensku,“ napísali autori. „Ďalšiu hybnú silu šírenia tejto epidemickej línie môže okrem fluorochinolónov predstavovať použitie antibiotík makrolid-linkozamid-streptogramín B. Pri C. difficile by mala byť rezistencia na linezolid fenotypovo potvrdená u kmeňov s zisteným cfr-génom ).“

Plankaová, A., Brajerová, M., Čapek, V., Novotná, GB, Kinross, P., Skalová, J., Šoltésová, A., Drevinek, P., & Krutová, M. (2023). Infekcie vyvolané Clostridium difficile na Slovensku v rokoch 2018 – 2019 boli spôsobené najmä fluorochinolón-rezistentnými ribotypmi C. difficile 176 a 001. International Journal of Antimicrobial Agents106824. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2023.106824